Ils sont, contrairement aux testicules, à l'intérieur de l'abdomen. Les ovaires sont des glandes génitales. Ils deviennent fonctionnels à la puberté. Ils fabriques des hormones : les œstrogènes et la progestérone. Ce sont des hormones féminines et elles sont responsables de l'apparition des caractères sexuels secondaires de la femmes : l'apparition des seins, la pilosité, la répartition des graisses,...
La sécrétion d'hormones sexuelles féminines est cyclique par période de 28 jours environ : d'abord une phase de maturation des ovules grâce à la sécrétion des œstrogènes puis l'ovulation vers le 14e jour de chaque cycle et la 2e phase de préparation de la muqueuse utérine à la nidation grâce à la progestérone pour un éventuel ovule fécondé par un spermatozoïde.
Lorsque le système hormonal féminin est déséquilibré, l'ovulation peut ne pas avoir lieu, la femme n'aura pas de règle, elle sera stérile.